17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0080 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0080  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249942  hitchhiker  0.00446925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0079  tRNA-Cys  98.61 
 
 		 74 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342909  hitchhiker  0.0044915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  95.52 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  91.67 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 71 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0022  tRNA-OTHER  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  89.83 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  88.71 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>