28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PGt53 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PGt53  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000393172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0027    94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583398  normal  0.0425769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0027  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.925736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0031  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.392405  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0535  tRNA-Cys  96.55 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA45  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>