11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0015 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0018  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000556933  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0026  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.19833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0014  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>