10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0018 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000556933  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0026  tRNA-Gln  87.84 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0026  tRNA-Gln  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0681318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0019  tRNA-Gln  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>