21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0015 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0013  tRNA-Gln  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0422006 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0014  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0056  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0607311  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0019  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0018  tRNA-Gln  90 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000556933  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0001  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0029  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.12848  normal  0.245159 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0003  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.270381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0027  tRNA-Gln  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.803766  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0026  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0010  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.78413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0016  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0206825  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0026  tRNA-Gln  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0681318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>