15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0026 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_R0026  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  89.04 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0031  tRNA-Gln  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0018  tRNA-Gln  90.91 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0030  tRNA-Gln  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0018  tRNA-Gln  87.84 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000556933  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0026  tRNA-Gln  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0681318  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0027  tRNA-Gln  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.803766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0045  tRNA-Glu  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.942532  normal  0.960719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0046  tRNA-Glu  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.960937  normal  0.776399 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0002  tRNA-Gln  84.48 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0014  tRNA-Gln  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>