9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0014 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0014  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0057  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0020  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308645  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0064  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0015  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0005  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0056  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0026  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>