23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2812 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  91.11 
 
 
135 aa  258  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  70.15 
 
 
135 aa  202  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  48.51 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  49.62 
 
 
136 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  50.39 
 
 
136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  46.27 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  47.37 
 
 
136 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  47.37 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  46.27 
 
 
153 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  46.88 
 
 
136 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0208424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  43.61 
 
 
142 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  46.51 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  49.23 
 
 
137 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  39.55 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  46.92 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1615  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1139  hypothetical protein  27.19 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2158  Protein of unknown function DUF2000  28.35 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>