20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4940 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  97.78 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  93.33 
 
 		 135 aa  253  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  93.33 
 
 		 135 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  92.59 
 
 		 135 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  92.59 
 
 		 135 aa  247  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  70.9 
 
 		 136 aa  190  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  69.4 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  173  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  58.96 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  48.51 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  46.27 
 
 		 135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  54.14 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  48.12 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  47.37 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  50.37 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  50.76 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0208424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  45.86 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>