21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4316 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  82.22 
 
 		 136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  80.29 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  51.82 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  52.99 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  51.82 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  50.75 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  53.28 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  50.75 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  50.75 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  50.75 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  51.94 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  50.39 
 
 		 135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  51.85 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0208424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  46.67 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  44.12 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  51.85 
 
 		 154 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1615  hypothetical protein  30.6 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>