21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4201 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  61.97 
 
 
153 aa  173  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  58.16 
 
 
142 aa  167  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  55.64 
 
 
135 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  52.24 
 
 
135 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  54.89 
 
 
135 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  54.14 
 
 
135 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  55.88 
 
 
136 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0208424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  51.85 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  51.11 
 
 
136 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  53.33 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  49.63 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  52.94 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  49.63 
 
 
136 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  48.51 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  46.15 
 
 
135 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  46.92 
 
 
135 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1139  hypothetical protein  22.13 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>