13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1139 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1139  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1615  hypothetical protein  34.09 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4273  hypothetical protein  33.08 
 
 
145 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223095  normal  0.264432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8184  hypothetical protein  32.59 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2158  Protein of unknown function DUF2000  27.41 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2541  hypothetical protein  27.82 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1448  hypothetical protein  30.37 
 
 
139 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0101889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  24.22 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  23.77 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  27.19 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  26.32 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06608  hypothetical protein  24.09 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0133  hypothetical protein  27.01 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0257423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>