22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1615 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1615  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1139  hypothetical protein  34.09 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4273  hypothetical protein  47.37 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223095  normal  0.264432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2158  Protein of unknown function DUF2000  36.84 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8184  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2541  hypothetical protein  35.88 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  35.77 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  29.37 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0133  hypothetical protein  26.12 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0257423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  30.53 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  31.34 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06608  hypothetical protein  26.62 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  27.69 
 
 
142 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  27.03 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  31.47 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  27.48 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1477  hypothetical protein  24.24 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1448  hypothetical protein  33.8 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0101889  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  27.7 
 
 
137 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>