21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1640 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  278  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  82.22 
 
 		 136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  73.53 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  51.11 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  49.63 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  46.67 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  45.93 
 
 		 136 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  48.12 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  48.89 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  46.62 
 
 		 135 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  47.37 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  53.33 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  45.86 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  47.29 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  46.51 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  52.59 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0208424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  41.48 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1615  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>