20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3401 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3401  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1397  hypothetical protein  77.21 
 
 
136 aa  215  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671199  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2725  hypothetical protein  75.74 
 
 
136 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0067  hypothetical protein  72.59 
 
 
136 aa  208  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5278  hypothetical protein  67.91 
 
 
135 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3358  hypothetical protein  67.16 
 
 
135 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5009  hypothetical protein  67.16 
 
 
135 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.832057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3633  hypothetical protein  67.16 
 
 
135 aa  180  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4422  hypothetical protein  64.18 
 
 
135 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4940  hypothetical protein  64.18 
 
 
135 aa  173  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79785  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05501  hypothetical protein  51.88 
 
 
135 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.969525  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4316  hypothetical protein  53.28 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2553  hypothetical protein  48.12 
 
 
135 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2812  hypothetical protein  47.37 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7519  hypothetical protein  47.41 
 
 
153 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2164  hypothetical protein  45.19 
 
 
142 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5309  hypothetical protein  48.91 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.292948  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1640  hypothetical protein  48.89 
 
 
136 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211578  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4201  hypothetical protein  51.11 
 
 
154 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0620  hypothetical protein  49.63 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0208424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>