24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1856 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  92.96 
 
 
85 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  92.96 
 
 
85 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  53.03 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  53.62 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  53.03 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  50.75 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  52.38 
 
 
87 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  50 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  50 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  47.06 
 
 
87 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  43.33 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  38.03 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1300  protein of unknown function DUF982  42.37 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731891  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  39.68 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  38.1 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1211  protein of unknown function DUF982  40.35 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1530  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3115  hypothetical protein  39.68 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.830563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  37.31 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  37.88 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  38.98 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  35.38 
 
 
86 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.586338 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  38.1 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>