23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6076 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  79.55 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  79.55 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  55.81 
 
 
87 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  56.98 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  51.16 
 
 
87 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  51.76 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  46.25 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  47.44 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  47.67 
 
 
87 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  53.03 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  38.1 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  40.85 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  34.72 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3115  hypothetical protein  35.62 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.830563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  40.96 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1530  hypothetical protein  34.25 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  40.3 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  36.21 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  34.29 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1300  protein of unknown function DUF982  32.5 
 
 
81 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731891  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  38.89 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1211  protein of unknown function DUF982  32.86 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>