23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2447 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  83.91 
 
 
87 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  68.97 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  54.02 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  51.76 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  49.43 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  48.24 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  48.72 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  48.72 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  47.06 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  53.62 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  40.48 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  44.83 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  40.85 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  38.18 
 
 
103 aa  47.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  36.11 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  41.67 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  51.92 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  43.4 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3115  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.830563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0848  hypothetical protein  44.74 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.40249  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  34.72 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.586338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>