19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7214 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  91.26 
 
 
103 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  79.55 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  54.65 
 
 
96 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  49.43 
 
 
87 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  52.87 
 
 
87 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  49.43 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  44.83 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  46.15 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  45 
 
 
85 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  40.48 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  50.75 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  40 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1912  hypothetical protein  44.26 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  38.33 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  34.94 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  43.86 
 
 
82 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  34.29 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>