19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4386 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1690  hypothetical protein  41.33 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.748487  normal  0.448156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  38.67 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  37.33 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  37.84 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0234  protein of unknown function DUF982  44.07 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0262  protein of unknown function DUF982  46.3 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  35.14 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.586338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  40.32 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  38.36 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  38.36 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  34.94 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5427  protein of unknown function DUF982  35.62 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  41.94 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5201  protein of unknown function DUF982  32.14 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  38.1 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  40.32 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  33.77 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>