15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2495 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  37.5 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  37.18 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  36.49 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  37.84 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  38.03 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1690  hypothetical protein  36.62 
 
 
78 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.748487  normal  0.448156 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  35.21 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  35.21 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  36.21 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5817  protein of unknown function DUF982  32.05 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  30.86 
 
 
169 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1530  hypothetical protein  33.71 
 
 
94 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  43.4 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3680  protein of unknown function DUF1555  45 
 
 
262 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>