13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4380 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.586338 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  44.16 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  35.14 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1690  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.748487  normal  0.448156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  36 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  39.19 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  35.38 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  33.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  33.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  37.14 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  34.72 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  33.77 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  35.38 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>