21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1752 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  55.81 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  54.02 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  51.72 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  52.87 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  49.43 
 
 
87 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  51.16 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  45.35 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  52.38 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  50.79 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  50.79 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  40.28 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  44.64 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3115  hypothetical protein  38.71 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.830563  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  32.86 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1211  protein of unknown function DUF982  37.84 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  47.06 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1300  protein of unknown function DUF982  42.11 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731891  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  42.31 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  41.18 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4380  hypothetical protein  35.38 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.586338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>