24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6941 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
87 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  83.91 
 
 
87 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0551  protein of unknown function DUF982  75.86 
 
 
87 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1752  protein of unknown function DUF982  51.72 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94231  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6076  protein of unknown function DUF982  51.16 
 
 
88 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7214  protein of unknown function DUF982  49.43 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.633985  normal  0.134977 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6056  protein of unknown function DUF982  47.67 
 
 
103 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4220  protein of unknown function DUF982  45.35 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.536998  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  42.5 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  43.04 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  50 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5017  protein of unknown function DUF982  41.67 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  44.83 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4387  hypothetical protein  45.16 
 
 
169 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.973925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0102  protein of unknown function DUF982  35.62 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1910  hypothetical protein  49.15 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1211  protein of unknown function DUF982  38.57 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1665  hypothetical protein  41.38 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343302  normal  0.10728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  34.55 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3115  hypothetical protein  34.25 
 
 
82 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.830563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1634  hypothetical protein  38.89 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  40.32 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0848  hypothetical protein  42.11 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.40249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1300  protein of unknown function DUF982  36.99 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>