14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5201 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5201  protein of unknown function DUF982  100 
 
 
93 aa  188  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5558  protein of unknown function DUF982  62.11 
 
 
103 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.00442438 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4627  hypothetical protein  52.13 
 
 
101 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2447  protein of unknown function DUF982  40.35 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134704  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2495  protein of unknown function DUF982  33.78 
 
 
130 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32395  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6330  protein of unknown function DUF982  35.9 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4386  hypothetical protein  35.06 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.909568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1653  protein of unknown function DUF982  35.9 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.248903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1856  protein of unknown function DUF982  34.78 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168584  normal  0.22577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6941  protein of unknown function DUF982  36.84 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0590571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2444  protein of unknown function DUF982  34.94 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935976  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5427  protein of unknown function DUF982  30.67 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2144  hypothetical protein  36 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.824866  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0848  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.40249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>