24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1503 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
367 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1701  conserved hypothetical conserved membrane protein  94.28 
 
 
367 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  44.38 
 
 
370 aa  286  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  36.27 
 
 
378 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  33.42 
 
 
376 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  36.2 
 
 
334 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  29.22 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  35.07 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  29.89 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  25.34 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  26.87 
 
 
416 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  26.09 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  25.52 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  23.22 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  32.58 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  33.33 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  25.57 
 
 
703 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  28.82 
 
 
697 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  33.33 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  24.29 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  23.65 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  24.29 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  23.87 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  24.53 
 
 
389 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>