41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0415 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  58.02 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  52.46 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  52 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  46.32 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  44.53 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  43.75 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  47.5 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  42.97 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  41.41 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  41.41 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  39.53 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  38.46 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  38.46 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  43.9 
 
 		 200 aa  97.1  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  38.14 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  38.14 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  38.14 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  38.46 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  38.46 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  42.74 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  39.84 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  38.14 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  38.26 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  44.53 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  44.53 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  38.26 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  42.62 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  41.22 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  32.23 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  38.66 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  44.07 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  45.13 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  37.4 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  37.4 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  40.48 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  40.83 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  40.37 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  36.99 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  34.94 
 
 		 499 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  38.98 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>