41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3959 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 140 aa  276  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 140 aa  276  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  53.39 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  48.18 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  49.61 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  44.53 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  41.09 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  40.8 
 
 		 187 aa  86.3  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  43.41 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  39.66 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  36.03 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  34.56 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  34.56 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  38.71 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  39.17 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  31.85 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  36.67 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  36.84 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  32.58 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  32.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  39.67 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  37.8 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  28.67 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  28.67 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  28.45 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  40 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  34.12 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  34 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  32.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  27.61 
 
 		 482 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  35.44 
 
 		 499 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  33.03 
 
 		 504 aa  42  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>