38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2701 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  100 
 
 
154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  51.16 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  46.88 
 
 
150 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  44.2 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  42.31 
 
 
164 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  45.93 
 
 
149 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  40.3 
 
 
142 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  40.8 
 
 
139 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  40.8 
 
 
139 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  39.84 
 
 
140 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  36.42 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  42.98 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  41.01 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  36.64 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  36.64 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  40.8 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  38.78 
 
 
144 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  39.39 
 
 
146 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  38.28 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  36.36 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  36.55 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  39.68 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  39.84 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  37.01 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  39.84 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  34.68 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  43.68 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  35.56 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  36.44 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  26.09 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>