39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1647 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  100 
 
 
153 aa  306  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  51.18 
 
 
149 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  50.76 
 
 
150 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  43.26 
 
 
143 aa  117  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  44.53 
 
 
139 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  48.18 
 
 
140 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  48.18 
 
 
140 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  36.64 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  36.64 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  36.64 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  35.61 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 
187 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  37.68 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  42.5 
 
 
164 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  36.36 
 
 
146 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  40.52 
 
 
200 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 
135 aa  84.7  5e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  41.38 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  38.98 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  33.85 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  40.77 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  41.79 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  33.08 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  32.31 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  36.44 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  35.54 
 
 
136 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  36.36 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  37.61 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  37.61 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  40.83 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  39.71 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  35.53 
 
 
173 aa  40  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>