44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2158 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 150 aa  300  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  58.02 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  45 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  46.48 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  47.06 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  43.75 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  46.56 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  49.61 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  49.61 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  46.32 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  38.76 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  38.76 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  38.76 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  36.72 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  38.19 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  40.14 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  38.57 
 
 		 187 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  43.08 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  37.21 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  36.43 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  40.68 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  33.33 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  41.53 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  39.17 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  34.88 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  34.88 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  37.59 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  35.82 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  35.82 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  37.5 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  36.57 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  33.58 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  32.43 
 
 		 499 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  35.96 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  36.99 
 
 		 482 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  42.37 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  38.82 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  38.82 
 
 		 175 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>