39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1439 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  45.74 
 
 
164 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  46.92 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  46.32 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  43.26 
 
 
153 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  47.33 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  45.6 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  45.38 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  40 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  49.18 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  44.62 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  43.85 
 
 
139 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  43.85 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  43.33 
 
 
200 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  42.5 
 
 
199 aa  103  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  43.65 
 
 
139 aa  103  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  43.65 
 
 
139 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  44.19 
 
 
140 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  39.5 
 
 
136 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  44.44 
 
 
142 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  47.79 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  38.24 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  45.26 
 
 
143 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  39.83 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  39.44 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  39.55 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  39.55 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  41.41 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  41.41 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  37.14 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  35.66 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  33.61 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  38.71 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>