47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2051 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  77.78 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  48.5 
 
 
187 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  49.17 
 
 
164 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  48.25 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  40.91 
 
 
139 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  43.33 
 
 
143 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  40.15 
 
 
139 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  45.83 
 
 
139 aa  104  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  43.09 
 
 
139 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  43.09 
 
 
139 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  51.85 
 
 
145 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  43.9 
 
 
139 aa  97.1  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  43.1 
 
 
136 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  37.9 
 
 
139 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  37.9 
 
 
139 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  37.17 
 
 
140 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  38.3 
 
 
146 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  37.7 
 
 
142 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  38.3 
 
 
147 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  42.37 
 
 
154 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  40.52 
 
 
153 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  40.41 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  41.53 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  37.31 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  37.1 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  36.43 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  35.48 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  38.18 
 
 
135 aa  67.4  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  37.8 
 
 
143 aa  62  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  39.67 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  39.67 
 
 
140 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2529  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.69 
 
 
471 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  28.91 
 
 
482 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  29.69 
 
 
471 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.34 
 
 
478 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  28.12 
 
 
480 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  27.34 
 
 
478 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  28.12 
 
 
488 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  27.34 
 
 
478 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  28.12 
 
 
476 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>