38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0448 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0448  putative disulfide oxidoreductase  100 
 
 		 135 aa  266  8.999999999999999e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1059  disulfide bond formation protein C  44.36 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.614204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0951  disulfide bond formation protein B  44.36 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0208  DsbB family disulfide bond formation protein  42.52 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.544206  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0321  disulfide bond formation protein C  38.24 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0144  disulfide bond formation protein, DsbB family protein  36.76 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0269  disulfide bond formation protein C  36.76 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0637  putative disulfide oxidoreductase  41.18 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.22709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0823  putative disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.722532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0672  putative disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0921  putative disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0660  putative disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0829  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.91106e-54 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0672  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0758  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0722  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4520  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0814  putative disulfide oxidoreductase  39.02 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0400  Disulfide bond formation protein DsbB  38.46 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0525  putative disulfide oxidoreductase  38.89 
 
 		 146 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1513  Disulfide bond formation protein DsbB  40.71 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1647  disulfide oxidoreductase  39.84 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4132  disulphide bond formation protein DsbB  37.4 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.695948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2701  DsbB family disulfide bond formation protein  38.28 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0415  disulphide bond formation protein DsbB  40.83 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3287  disulphide bond formation protein DsbB  34.31 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00832503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0691  disulphide bond formation protein DsbB  37.24 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1439  Disulphide bond formation protein DsbB  35.66 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  36.64 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1386  putative disulfide oxidoreductase  39.62 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1773  disulphide bond formation protein DsbB  33.85 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0576075  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2051  disulphide bond formation protein DsbB  35.48 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3244  Disulphide bond formation protein DsbB  33.06 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0019  disulfide bond formation protein B  33.6 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000650277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1885  Disulphide bond formation protein DsbB  43.42 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.096749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0685  Disulphide bond formation protein DsbB  37.4 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.994165 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3621  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.566272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3959  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>