21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3815 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  100 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  80.85 
 
 		 47 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  61.7 
 
 		 46 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  61.7 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  61.7 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  59.57 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  55.32 
 
 		 46 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  58.54 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  53.19 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  54.55 
 
 		 44 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  38.78 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  45.45 
 
 		 44 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1172  entericidin EcnAB  64.52 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  51.16 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  53.85 
 
 		 43 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  51.22 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3927  entericidin EcnAB  36.96 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  44.44 
 
 		 45 aa  42  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  42.55 
 
 		 46 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  42.55 
 
 		 46 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  47.73 
 
 		 43 aa  40  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>