30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2661 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  100 
 
 
44 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  97.73 
 
 
62 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  68.18 
 
 
44 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  68.18 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  72.5 
 
 
43 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  57.14 
 
 
44 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1513  entericidin EcnAB  76.19 
 
 
45 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.839943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1205  entericidin-related protein  72.73 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0196  bacteriolytic lipoprotein entericidin B.-related protein  72.73 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  50 
 
 
44 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1685  entericidin EcnAB  72.73 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1603  bacteriolytic lipoprotein entericidin B  72.73 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  47.73 
 
 
47 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 
46 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 
46 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  54.55 
 
 
46 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  45.45 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  58.97 
 
 
42 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  46.51 
 
 
45 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  43.18 
 
 
44 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  52 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  68.97 
 
 
46 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  65.52 
 
 
46 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  65.52 
 
 
46 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  44.19 
 
 
43 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>