26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0151 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 46 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  95.65 
 
 		 46 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  84.78 
 
 		 46 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  78.26 
 
 		 46 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  78.26 
 
 		 46 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  76.09 
 
 		 46 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  55.32 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  53.19 
 
 		 47 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  69.7 
 
 		 42 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  62.79 
 
 		 44 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  55.56 
 
 		 44 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  56.41 
 
 		 45 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  68.97 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 44 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  56.76 
 
 		 43 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  45.24 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1920  entericidin EcnAB  52.5 
 
 		 41 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1172  entericidin EcnAB  48.65 
 
 		 49 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  65.52 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  48.89 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  60 
 
 		 42 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>