27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4285 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 46 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 46 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  91.3 
 
 		 46 aa  84.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  76.09 
 
 		 46 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  78.26 
 
 		 46 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  76.09 
 
 		 46 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  61.7 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  55.32 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  59.09 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  64.29 
 
 		 44 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  56.82 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  58.54 
 
 		 42 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2313  entericidin EcnAB  65 
 
 		 42 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  52.38 
 
 		 45 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  45.24 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2474  entericidin EcnAB  63.41 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.376001 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  45.24 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0915  entericidin EcnAB  40.43 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02851  hypothetical protein  51.16 
 
 		 50 aa  40.8  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  52.5 
 
 		 43 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1254  Entericidin EcnAB  43.59 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.250301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>