10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1254 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1254  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 46 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.250301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  51.28 
 
 		 44 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  48.72 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02852  entericidin EcnA/B family  52.63 
 
 		 39 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0972  entericidin EcnAB  47.5 
 
 		 46 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.715392  hitchhiker  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1172  entericidin EcnAB  60.53 
 
 		 49 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  43.59 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  50 
 
 		 45 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  43.59 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  43.59 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>