14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0972 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0972  entericidin EcnAB  100 
 
 
46 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.715392  hitchhiker  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  69.57 
 
 
46 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  69.57 
 
 
46 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  51.16 
 
 
43 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  47.62 
 
 
44 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  52.5 
 
 
44 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  40.48 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1254  Entericidin EcnAB  47.5 
 
 
46 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.250301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  51.61 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  40.48 
 
 
44 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  43.48 
 
 
46 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1994  entericidin EcnAB  45 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  40 
 
 
44 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  40 
 
 
44 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>