26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1169 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  100 
 
 
46 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  100 
 
 
46 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0972  entericidin EcnAB  69.57 
 
 
46 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.715392  hitchhiker  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  47.92 
 
 
48 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  47.73 
 
 
44 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  46.51 
 
 
43 aa  43.9  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2195  hypothetical protein  46.34 
 
 
45 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.9051  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  42.55 
 
 
58 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1994  entericidin EcnAB  45.65 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  38.3 
 
 
47 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  43.59 
 
 
41 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1868  Entericidin EcnAB  53.49 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.545291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  42.55 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>