16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1424 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 46 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  51.11 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  51.11 
 
 		 44 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  47.83 
 
 		 44 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  51.16 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  51.16 
 
 		 47 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  52.38 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02852  entericidin EcnA/B family  62.96 
 
 		 39 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  53.12 
 
 		 42 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  45.24 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  50 
 
 		 46 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0972  entericidin EcnAB  43.48 
 
 		 46 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.715392  hitchhiker  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  50 
 
 		 46 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  42.86 
 
 		 43 aa  40  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  44.19 
 
 		 42 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01751  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  40  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0868343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>