23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3459 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 42 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  92.86 
 
 		 43 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  64.29 
 
 		 42 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  57.14 
 
 		 41 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  55.81 
 
 		 44 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  52.38 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  55.26 
 
 		 44 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4617  entericidin A  59.52 
 
 		 41 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.212391 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  55.26 
 
 		 44 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4732  putative entericidin A  53.49 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  59.38 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  59.38 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  59.38 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  48.78 
 
 		 48 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4696  putative entericidin A  53.49 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4605  putative entericidin A  53.49 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.662753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  44.19 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>