44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4806 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  100 
 
 
44 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  100 
 
 
44 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  100 
 
 
44 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  95.45 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  97.73 
 
 
44 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  97.73 
 
 
44 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  90.91 
 
 
44 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  70.45 
 
 
44 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  68.18 
 
 
62 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1603  bacteriolytic lipoprotein entericidin B  81.82 
 
 
44 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0196  bacteriolytic lipoprotein entericidin B.-related protein  81.82 
 
 
44 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1205  entericidin-related protein  81.82 
 
 
44 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1685  entericidin EcnAB  81.82 
 
 
44 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  60 
 
 
43 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1513  entericidin EcnAB  69.05 
 
 
45 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.839943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4767  entericidin AB  60.61 
 
 
42 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.718834  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  56.82 
 
 
48 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  52.38 
 
 
46 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  61.11 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  48.84 
 
 
45 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 
48 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  47.62 
 
 
46 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  52.5 
 
 
44 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  42.86 
 
 
44 aa  42.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  45.24 
 
 
46 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  40.91 
 
 
44 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3764  Entericidin EcnAB  51.35 
 
 
43 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  42.86 
 
 
46 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4285  Entericidin EcnAB  42.86 
 
 
46 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3942  Entericidin EcnAB  56.25 
 
 
43 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4173  Entericidin EcnAB  42.86 
 
 
46 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.653132  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4284  bacteriolytic lipoprotein entericidin AB  46.34 
 
 
47 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  59.38 
 
 
42 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0414  entericidin EcnAB  54.05 
 
 
43 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2947  entericidin EcnAB  44.19 
 
 
43 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00524222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  51.22 
 
 
42 aa  40  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3927  entericidin EcnAB  42.22 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>