19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3614 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  100 
 
 
43 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  92.86 
 
 
42 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  61.9 
 
 
42 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  60.47 
 
 
41 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  59.09 
 
 
44 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4732  putative entericidin A  59.09 
 
 
58 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4617  entericidin A  62.79 
 
 
41 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.212391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4605  putative entericidin A  59.09 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.662753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4696  putative entericidin A  59.09 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4613  putative entericidin A  59.09 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4753  putative entericidin A  59.09 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.617132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1424  Entericidin EcnAB  45.24 
 
 
46 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0413  entericidin EcnAB  59.52 
 
 
42 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>