29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4753 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4753  putative entericidin A  100 
 
 
57 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.617132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4613  putative entericidin A  98.25 
 
 
58 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4605  putative entericidin A  98.25 
 
 
57 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.662753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4696  putative entericidin A  96.49 
 
 
58 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4732  putative entericidin A  92.98 
 
 
58 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  75 
 
 
41 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  61.36 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  59.09 
 
 
43 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4617  entericidin A  72.73 
 
 
41 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.212391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  53.49 
 
 
42 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  53.49 
 
 
42 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  50 
 
 
48 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0413  entericidin EcnAB  79.17 
 
 
42 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1868  Entericidin EcnAB  43.4 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.545291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0414  entericidin EcnAB  48.84 
 
 
43 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>