29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04018 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  100 
 
 		 41 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4617  entericidin A  97.56 
 
 		 41 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.212391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  60.47 
 
 		 43 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4696  putative entericidin A  75 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4605  putative entericidin A  75 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.662753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4732  putative entericidin A  77.27 
 
 		 58 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4613  putative entericidin A  75 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4753  putative entericidin A  75 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.617132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  57.14 
 
 		 42 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  55.56 
 
 		 42 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  54.55 
 
 		 48 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0413  entericidin EcnAB  75 
 
 		 42 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1146  entericidin EcnAB  52.78 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.453448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  43.59 
 
 		 46 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  43.59 
 
 		 46 aa  40.4  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>