33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0769 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  100 
 
 
42 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3459  Entericidin EcnAB  64.29 
 
 
42 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3614  Entericidin EcnAB  61.9 
 
 
43 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  55.56 
 
 
41 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0413  entericidin EcnAB  83.33 
 
 
42 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  48.78 
 
 
44 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  47.62 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  54.05 
 
 
48 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4732  putative entericidin A  70.83 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4613  putative entericidin A  73.91 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4605  putative entericidin A  70.83 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.662753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4753  putative entericidin A  73.91 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.617132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4696  putative entericidin A  70.83 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  53.66 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4617  entericidin A  64 
 
 
41 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.212391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  51.22 
 
 
44 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  51.35 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  51.22 
 
 
44 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  51.22 
 
 
44 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  51.22 
 
 
44 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>