31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04019 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  100 
 
 		 48 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  91.67 
 
 		 48 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0414  entericidin EcnAB  62.79 
 
 		 43 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3764  Entericidin EcnAB  55.81 
 
 		 43 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  52.27 
 
 		 44 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3942  Entericidin EcnAB  53.49 
 
 		 43 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  56.82 
 
 		 44 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  54.55 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  54.55 
 
 		 41 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  52.27 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3927  entericidin EcnAB  53.49 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  51.35 
 
 		 42 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1169  entericidin EcnAB  42.55 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000108123  hitchhiker  0.000475974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1223  entericidin A lipoprotein  42.55 
 
 		 46 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000610188  normal  0.0180806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>