27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3927 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3927  entericidin EcnAB  100 
 
 		 75 aa  150  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  53.49 
 
 		 44 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  39.39 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0093  entericidin EcnAB  80.77 
 
 		 44 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805686  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03981  hypothetical protein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04019  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5665  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4679  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4618  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161287 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3863  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.20506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4391  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0335  entericidin B membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3815  entericidin EcnAB  36.96 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.823038  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  41.86 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3843  Entericidin EcnAB  53.49 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0007  entericidin EcnAB  48.89 
 
 		 110 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  45 
 
 		 43 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  43.18 
 
 		 44 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0414  entericidin EcnAB  37.21 
 
 		 43 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  35.38 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0334  entericidin EcnAB  44.19 
 
 		 44 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  42.22 
 
 		 44 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  42.22 
 
 		 44 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  42.22 
 
 		 44 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  42.22 
 
 		 44 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  42.22 
 
 		 44 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>